Valore prognostico e modelli di co-espressione delle vie metaboliche nei tumori

Dan Zhang, Yan Guo e Ni Xie | Dicembre 29, 2020
sfondo: Le vie metaboliche anormali sono state considerate uno dei segni distintivi del cancro. Mentre
numerose vie metaboliche sono state studiate in vari tumori, il collegamento diretto tra le vie metaboliche
l'espressione genica e la prognosi del cancro non sono state stabilite.
risultati: Utilizzando due metodi di analisi bioinformatica recentemente sviluppati, abbiamo valutato il potenziale di prognosi di
espressione della via metabolica e disregolazioni tumore-vs-normale per un massimo di 29 vie metaboliche in 33 tumori
tipi. I risultati mostrano che una maggiore espressione del gene metabolico all'interno dei tumori corrisponde a una prognosi infausta del cancro.
L'analisi della coespressione differenziale meta ha identificato quattro percorsi metabolici con una coespressione globale significativa
disturbo della rete tra tumore e campioni normali. Analisi dell'espressione differenziale delle vie metaboliche
ha anche dimostrato un forte disturbo dell'espressione genica tra tumore accoppiato e campioni normali.
Conclusione: Presi insieme, questi risultati suggeriscono fortemente che le espressioni geniche della via metabolica lo siano
disturbato dopo la tumorigenesi. All'interno dei tumori, molte vie metaboliche sono sovraregolate per l'attivazione delle cellule tumorali
corrispondenti metabolici per sostenere l'energia necessaria per la divisione cellulare.
parole: Via metabolica, Analisi della meta coespressione, Punteggio composito dell'espressione genica, Cancro

L'autozigosi globale è associata a rischio di cancro, firma mutazionale e prognosi

Limin Jiang, Fei Guo, Jijun Tang, Shuguan Leng, Scott Ness, Fei Ye, Huining Kang, David C. Samuels e Yan Guo | Dicembre 04, 2020
L'autozigosi globale sotto forma di cicli di omozigosi è associata a varie malattie. Il rapporto di eterozigosi, una misura alternativa dell'autozigosi globale, viene utilizzato per valutare il rischio di cancro in questo studio. La nostra analisi mostra associazioni forti e coerenti tra rapporti di eterozigosi e vari tipi di cancro. Ulteriori analisi rivelano le potenziali connessioni del rapporto di eterozigosi con le firme mutazionali e la prognosi del cancro.