Le immagini delle sezioni di tessuto colorate immunoistochimicamente o delle sezioni di immunofluorescenza vengono acquisite sullo scanner digitale Leica Versa 200 e caricate nel software di imaging e annotazione HALO. Il software HALO consente di annotare il tessuto (tumore, stroma, muscolo, grasso ecc.) e quindi contare le cellule positive per la proteina di scelta (Figura) all'interno di ciascuna di queste regioni annotate.
Ti consentirà inoltre di analizzare e quantificare le interazioni con i vicini più prossimi. Il software include uno strumento per la creazione di figure in grado di creare foto multi-pannello di immagini in formati pubblicabili, inclusi fotogrammi di riferimento e barre di scala.
Il pannello in alto a sinistra mostra il campione di microarray tissutale, il pannello centrale mostra la colorazione Ki67 (marrone) senza il markup HALO e il pannello di destra mostra la stessa immagine con il markup HALO.
Il markup mostra una colorazione di basso livello (giallo), moderata (marrone) e alti livelli (rosso) di Ki67 nel nucleo delle cellule tumorali. La colorazione blu sono cellule negative per Ki67. Il software può contare indipendentemente la colorazione Ki67 nello stoma del tumore. La tabella mostra una lettura del numero e della percentuale di cellule in ciascuna categoria di colorazione e l'istogramma mostra la distribuzione della colorazione.